【推荐】pubmed 检索具体操作方法

高塔

近年来，随着INTERNET的普及，一些机构通过INTERNET提供MEDLINE数据库免费检索服务，如美国国立卫生院提供的PubMed检索系统(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/)、由广告商提供的HEALTHGATE检索系统(http://www.healthgate/medline/search.html)和MEDSCAPE检索系统(http://www.medscape.com/misc/formmedlineinflive.html/)、HELIX检索系统(http://www.helix.com)、MEDEC检索系统(http://medecinteractive.com/)等、AVICENNA检索系统(http://www.avicenna.com/)等。其中PubMed数据更新快，检索系统比较完善，深受广大医务工作者和图书情报人员的欢迎。但由于不少使用者不熟悉PubMed的使用方法，因而不用或少用，即便使用，检索结果也不太满意。本文拟简要介绍PubMed及其具体操作方法。
% U0 b, f+ B0 G, t( z. M4 T: c1 Y　　PubMed检索系统所提供的书目信息数据库主要来源于MEDLINE和PREMEDLINE。其中PREMEDLINE是指将要进入MEDLINE数据库的文献先做成一个数据库，数据为每天更新。PubMed提供了强大的技术支持。使用户可以非常容易地在普通检索界面进行检索(普通检索界面可通过布尔逻辑组配执行高级检索界面的功能)。
0 r- `: x! p( E
8 H3 x$ d, w! z1　主题检索
' H8 j5 {- h1 u  U5 Q
　　在检索式提问框中输入一个或更多的词，然后按回车键或用鼠标点击`search'按钮，PubMed就会利用`自动词语匹配'功能将重要的词或词组用`AND'组合在一起进行检索。当然，也可使用MeSH/副主题词组配格式(MeSH为Medical Subject Headings的缩写，是美国国立医学图书馆编写的医学主题词表)，如neoplasms/diet therapy［mh］**。“自动词语匹配”是检索系统将输入的检索词根据MeSH注释表、期刊名注释表、常用词组表和作者索引进行匹配。
: `4 J9 U5 C6 S) m; P  v7 @
7 z( p8 B: c( x5 f  T7 o+ z3 y1.1　MeSH注释表

　　MeSH注释表包括MeSH词、副主题词、MeSH词相关参照(也称款目词)、物质名称、物质名称同义词等。如果输入的检索词在注释表中发现有匹配的词，则该词将被作为MeSH词和自由词(即textword)同时进行检索。例如，如果我们输入Vitamin h,PubMed会这样检索：(“Biotin［MeSH］OR itaminh［tw］)——vitamin h是MeSH词Biotin的款目词。
9 A0 y4 O, O* z3 I( G, I
1.2　期刊名注释表

' [6 s# y: R: {2 Y　　包括期刊名全称、期刊名MEDLINE缩写、ISSN号。例如，如果你输入“New England Journal of Medicine”，PubMed将按“N Engl J Med［ta］”查询。

1.3　常用词组表

　　如果在MeSH注释表或期刊名注释表中未发现匹配的词，PubMED就会检索来自MeSH、物质名称、题名和文摘中多次出现的常用词组表，例如cold compresses。
6 F3 [# ^8 r, u) b8 Y% D
1.4　作者索引

7 A7 l9 Q9 D! d) A, \, O　　如果输入的检索词在以上词表中未找到，且该词后有一或二个字母，PubMed就会查检作者索引。如果在作者索引中仍未找到匹配词，PubMed就将该词组分开并重复上面的查找过程。如果还没有匹配词，PubMed将该词组的每个单词用`AND'组配并在所有字段中查找。

- T5 ^% K! M: \5 B& V. U% X2　作者姓名检索
# B5 h2 X+ M; J6 {" F
　　输入作者姓名时应采用姓+名(名的首字母缩写，不用标点符号)的格式，例如SmithJA。PubMed将自动地截取作者姓名中名的首字母以适应不同的名缩写。如果只输入作者的姓，PubMed会在包括作者字段在内的所有字段进行检索，例如只输入Yang,则PubMed将象下面一样检索：Yin-Yang［mh］或Yang［tw］。此外，如果使用双引号“”将作者的姓全称和名的第一个首字母引起来，并用作者检索字段标识符［au］限制，如“smithj”［au］，PubMed将关闭自动截词，且检索姓名中名只有一个字母缩写的作者。
' p' U& G/ s) T7 D
# e' t5 P/ h, u; n- Y+ w3　期刊名称检索

　　可以输入期刊名全称检索，如molecular biology of the cell;期刊名MEDLINE缩写名称检索，如molbiolcell;或ISSN号检索，如1059-1524。
　　如果期刊名称正好是医学主题词表(MeSH)中的词，例如genetherapy、science、cell,PubMed会将其当作MeSH词进行检索。因此，在此种情况下应使用期刊名称检索字段标识［ta］，如genetherapy［ta］。
　　如果期刊名称是一个单词，也需要使用期刊名称检索字段标识，如scanning［ta］，否则会在所有字段检索该词。
9 J- U& p, I2 z2 ?6 B5 {, Y　　推荐使用期刊名称全称或MEDLINE缩写形式检索期刊。同时需要注意的是，在以前的引文中，ISSN号是不能保证的。
2 S! g+ i; V( s% F$ h3 n- A
4　截词检索

& G/ q; t: z$ J0 S7 r　　在词的末尾加*号，PubMed就会检索出以该词为词根的所有词，例如，staph*，但不包括*号后有一个空格的词组，譬如，infection*包括infections，但不包括infection control。此外，截词检索将关闭自动词语匹配功能，也不能进行扩展检索。如：heart attack*不会匹配MeSH词，也不会扩展检索my-ocardial infarction、myocardial stunning、shock,cardiogenic这些方面的文献。

5　词组检索(规定PubMed检索一个词组)

　　如果PubMed检索在常用词组列表中已有的词组，如poi-son ivy,PubMed就会把它作为一个词组来检索。但有时Pubmed可能找不到相应的词组，如brca1，此时可通过给一个词组加上双引号，使得PubMed将其当作一个词来进行检索，如“brca1”。需注意的是，使用双引号规定PubMed进行词组检索，PubMed就不会执行自动词语匹配功能和扩展检索功能。
2 [% `- L6 G- d! `1 u& H; i
6 q* [+ e% K/ i/ G' e5 M6 i1 d6　每页显示的文献数量

　　PubMed将检索出的文献记录按每页20条显示(缺省值)。要改变缺省值，单击`number of documents to display perpage'下拉菜单，并选择一个更大的值。

) [" r1 R: R0 `2 u" L& U7　检索时间范围限制

5 C3 E& [4 q8 r* [( z3 V　　使用`entrez date limit'下拉菜单可限制检索时间范围。`entrez date'是引文追加到PubMed数据库的日期。引文以文献记录入库时间顺序显示(倒序)。

/ K) N$ B; F/ U: S, d( a  D4 ^( j8　检出文献记录显示格式
6 M; F1 q. t1 @, n' ~/ X
　　使用“abstract report”(PubMed缺省显示方式)下拉菜单可选择文献记录显示形式。
　　①文摘报告：包括期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有)、出版类型、PubMed和MEDLINE登记号等。
　　②引文报告：期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有)、出版类型、MeSH词、资助号、PubMed和MEDLINE登记号等。
　　③MEDLINE报告：MEDLINE记录格式，采用二个字母的文献记录字段标识符。
! U. W3 Q8 N5 Q0 P4 f
( s! b9 z2 w/ q- i/ ]9　PubMed检索规则与语法
- \1 O" x' Q% E6 U9 e0 ^+ b9 t6 @& j# @
& T( O& r. r! Q3 ]% o) S　　①布尔运算符AND，OR，NOT必须大写，例如，vitaminc OR zinc；
　　②PubMed从左至右进行布尔运算。不过，你可以通过加圆括符改变运算顺序，如commoncoldAND(vitamincORzinc)。
- j1 c; T6 l4 j　　③指定文献记录字段名称检索，如dna［mh］ANDcrick［au］and1993［dp］。下面列出常用字段名称缩写：
% p' X" u+ V% z& \3 S: b2 s　　DP——出版日期　采用YYYY/MM/DD［DP］格式，如1998/03/06［DP］。输入日期范围则用冒号连接，如1996：1998［DP］，1998/01：1998/04［dp］
" N4 J" r$ Z- I# x9 F" v  b　　AD——第一作者机构名称、地址、资助号　如LM05545/LM/NLM［ad］
5 t; E" P  d8 ~+ b+ @　　AU——作者姓名　如o'brienj［au］
% X) L. r. Z% \1 g# s3 E: g- B　　TA——期刊名称　包括期刊名全称、简称、ISSN。jbiolchem［ta］或0021-9258［ta］
/ ~) l$ y+ _% X: [* n' L6 w　　LA——文献出版语言　Chinese［la］
　　MH-Mesh主题词　neoplasms［mh］或neoplasms/dt［mh］
7 B5 m' q. [& @  r0 Z+ [' |　　PT——出版类型　review［pt］
# V# n1 Q3 M$ T/ E; Y" P- e, z. a　　TW——自由词　AA001794［tw］
　　T1——文献标题内自由词leiomyosarcoma［ti］
　　④经常通过单击Details按钮观察PubMed怎样运算你的检索策略，并不断修正检索策略，以达到最佳检索结果。
7 ^5 ]* K/ }& H4 |- H$ c* a10　PubMed在提供的文献记录中，有些记录中出现有彩色标记的期刊名称缩写按钮，用鼠标点击该按钮，部分期刊将免费提供该记录的全文。