TA的每日心情 | 郁闷 2020-3-30 14:53 |
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近年来,随着INTERNET的普及,一些机构通过INTERNET提供MEDLINE数据库免费检索服务,如美国国立卫生院提供的PubMed检索系统(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/)、由广告商提供的HEALTHGATE检索系统(http://www.healthgate/medline/search.html)和MEDSCAPE检索系统(http://www.medscape.com/misc/formmedlineinflive.html/)、HELIX检索系统(http://www.helix.com)、MEDEC检索系统(http://medecinteractive.com/)等、AVICENNA检索系统(http://www.avicenna.com/)等。其中PubMed数据更新快,检索系统比较完善,深受广大医务工作者和图书情报人员的欢迎。但由于不少使用者不熟悉PubMed的使用方法,因而不用或少用,即便使用,检索结果也不太满意。本文拟简要介绍PubMed及其具体操作方法。
) d$ r3 d4 R: D E PubMed检索系统所提供的书目信息数据库主要来源于MEDLINE和PREMEDLINE。其中PREMEDLINE是指将要进入MEDLINE数据库的文献先做成一个数据库,数据为每天更新。PubMed提供了强大的技术支持。使用户可以非常容易地在普通检索界面进行检索(普通检索界面可通过布尔逻辑组配执行高级检索界面的功能)。
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1 主题检索
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) C- L4 U l/ D3 o8 e6 R+ H% S 在检索式提问框中输入一个或更多的词,然后按回车键或用鼠标点击`search'按钮,PubMed就会利用`自动词语匹配'功能将重要的词或词组用`AND'组合在一起进行检索。当然,也可使用MeSH/副主题词组配格式(MeSH为Medical Subject Headings的缩写,是美国国立医学图书馆编写的医学主题词表),如neoplasms/diet therapy[mh]**。“自动词语匹配”是检索系统将输入的检索词根据MeSH注释表、期刊名注释表、常用词组表和作者索引进行匹配。
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1.1 MeSH注释表
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MeSH注释表包括MeSH词、副主题词、MeSH词相关参照(也称款目词)、物质名称、物质名称同义词等。如果输入的检索词在注释表中发现有匹配的词,则该词将被作为MeSH词和自由词(即textword)同时进行检索。例如,如果我们输入Vitamin h,PubMed会这样检索:(“Biotin[MeSH]OR itaminh[tw])——vitamin h是MeSH词Biotin的款目词。 $ _" O" M' T% T- n9 R# i
- z( @! o% t: l1.2 期刊名注释表
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包括期刊名全称、期刊名MEDLINE缩写、ISSN号。例如,如果你输入“New England Journal of Medicine”,PubMed将按“N Engl J Med[ta]”查询。
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1.3 常用词组表 ; ~& q" z6 _+ @0 ?( {4 x$ o
& z; r# c) H2 V+ U! d, k 如果在MeSH注释表或期刊名注释表中未发现匹配的词,PubMED就会检索来自MeSH、物质名称、题名和文摘中多次出现的常用词组表,例如cold compresses。
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1.4 作者索引 : [" u3 f" N" Q7 P( K8 E; \( ^
1 \4 C2 x; y6 ]& l- O$ T- K 如果输入的检索词在以上词表中未找到,且该词后有一或二个字母,PubMed就会查检作者索引。如果在作者索引中仍未找到匹配词,PubMed就将该词组分开并重复上面的查找过程。如果还没有匹配词,PubMed将该词组的每个单词用`AND'组配并在所有字段中查找。
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6 F( d/ |- |. z$ j* L2 作者姓名检索 9 h8 s" y, f" N7 [& s/ ?. Q1 l$ `: c3 B
) j6 K* s4 N0 u% W% I 输入作者姓名时应采用姓+名(名的首字母缩写,不用标点符号)的格式,例如SmithJA。PubMed将自动地截取作者姓名中名的首字母以适应不同的名缩写。如果只输入作者的姓,PubMed会在包括作者字段在内的所有字段进行检索,例如只输入Yang,则PubMed将象下面一样检索:Yin-Yang[mh]或Yang[tw]。此外,如果使用双引号“”将作者的姓全称和名的第一个首字母引起来,并用作者检索字段标识符[au]限制,如“smithj”[au],PubMed将关闭自动截词,且检索姓名中名只有一个字母缩写的作者。
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8 T! q3 I4 _, b5 G! Y4 ?( p3 期刊名称检索
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可以输入期刊名全称检索,如molecular biology of the cell;期刊名MEDLINE缩写名称检索,如molbiolcell;或ISSN号检索,如1059-1524。
' V3 F! H m/ H1 r1 E5 V' I 如果期刊名称正好是医学主题词表(MeSH)中的词,例如genetherapy、science、cell,PubMed会将其当作MeSH词进行检索。因此,在此种情况下应使用期刊名称检索字段标识[ta],如genetherapy[ta]。 ; M1 f- f4 `" ]. A0 N: R
如果期刊名称是一个单词,也需要使用期刊名称检索字段标识,如scanning[ta],否则会在所有字段检索该词。
) p$ x) A! T; g6 ]- N7 c8 T 推荐使用期刊名称全称或MEDLINE缩写形式检索期刊。同时需要注意的是,在以前的引文中,ISSN号是不能保证的。
( y# r* E8 @0 T
' q* a3 q/ @3 S5 `- k% x3 a4 截词检索 & x4 @- z- { O; [) N3 z. k
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在词的末尾加*号,PubMed就会检索出以该词为词根的所有词,例如,staph*,但不包括*号后有一个空格的词组,譬如,infection*包括infections,但不包括infection control。此外,截词检索将关闭自动词语匹配功能,也不能进行扩展检索。如:heart attack*不会匹配MeSH词,也不会扩展检索my-ocardial infarction、myocardial stunning、shock,cardiogenic这些方面的文献。
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9 r: N4 r: W/ q# t5 词组检索(规定PubMed检索一个词组)
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如果PubMed检索在常用词组列表中已有的词组,如poi-son ivy,PubMed就会把它作为一个词组来检索。但有时Pubmed可能找不到相应的词组,如brca1,此时可通过给一个词组加上双引号,使得PubMed将其当作一个词来进行检索,如“brca1”。需注意的是,使用双引号规定PubMed进行词组检索,PubMed就不会执行自动词语匹配功能和扩展检索功能。 5 E u( k2 z0 M' i
P3 y6 {; B& M7 l- b6 每页显示的文献数量 8 O' I* J, n/ s+ Q' y$ |3 I6 A
G5 @; ~3 o& t& o: v/ I
PubMed将检索出的文献记录按每页20条显示(缺省值)。要改变缺省值,单击`number of documents to display perpage'下拉菜单,并选择一个更大的值。 . G! h, `: B3 ~( E( p0 c2 d) Z
7 {0 N ?. P3 B. q. d* @
7 检索时间范围限制
' y$ p, N5 N9 V4 H7 {) J; X e4 g8 ^# P; s
使用`entrez date limit'下拉菜单可限制检索时间范围。`entrez date'是引文追加到PubMed数据库的日期。引文以文献记录入库时间顺序显示(倒序)。
, a D/ E6 o p7 F% |% u4 |9 K2 U" Q K0 f
8 检出文献记录显示格式 . {! a. y. S) h3 d0 F
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使用“abstract report”(PubMed缺省显示方式)下拉菜单可选择文献记录显示形式。 1 B3 w% p( M8 s1 Z* ]
①文摘报告:包括期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有)、出版类型、PubMed和MEDLINE登记号等。
# V# S) ~' f7 m: Z) P! D. O ②引文报告:期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有)、出版类型、MeSH词、资助号、PubMed和MEDLINE登记号等。 2 D" Y1 I' T2 ~
③MEDLINE报告:MEDLINE记录格式,采用二个字母的文献记录字段标识符。
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8 o% j! Z# x# u" D# R% P% D9 PubMed检索规则与语法
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①布尔运算符AND,OR,NOT必须大写,例如,vitaminc OR zinc;
) K7 b/ a. B3 u+ c ②PubMed从左至右进行布尔运算。不过,你可以通过加圆括符改变运算顺序,如commoncoldAND(vitamincORzinc)。 / d" C- |$ V9 |' K6 h
③指定文献记录字段名称检索,如dna[mh]ANDcrick[au]and1993[dp]。下面列出常用字段名称缩写:
. S0 `: r; b8 u# [5 [ DP——出版日期 采用YYYY/MM/DD[DP]格式,如1998/03/06[DP]。输入日期范围则用冒号连接,如1996:1998[DP],1998/01:1998/04[dp] 3 Y+ w( k5 Y8 _! L
AD——第一作者机构名称、地址、资助号 如LM05545/LM/NLM[ad]
8 T" y, B. J' n0 b. A$ ~! [ AU——作者姓名 如o'brienj[au]
; W s, Z5 T/ _* s TA——期刊名称 包括期刊名全称、简称、ISSN。jbiolchem[ta]或0021-9258[ta]
( N& y' f+ z+ y0 Z$ o$ b LA——文献出版语言 Chinese[la]
, A- f3 N% n2 O' }9 y9 V8 e% ~& m MH-Mesh主题词 neoplasms[mh]或neoplasms/dt[mh] ; R7 l/ v7 y( O. W W1 o
PT——出版类型 review[pt]
) x+ F" h/ ?! G TW——自由词 AA001794[tw] 2 j* D8 e* K. _" [
T1——文献标题内自由词leiomyosarcoma[ti] * S7 l) x7 n+ K. q
④经常通过单击Details按钮观察PubMed怎样运算你的检索策略,并不断修正检索策略,以达到最佳检索结果。
! n* ~8 Z. \6 @; T9 h- H6 B+ k10 PubMed在提供的文献记录中,有些记录中出现有彩色标记的期刊名称缩写按钮,用鼠标点击该按钮,部分期刊将免费提供该记录的全文。 |
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