【推荐】pubmed 检索具体操作方法

高塔

近年来，随着INTERNET的普及，一些机构通过INTERNET提供MEDLINE数据库免费检索服务，如美国国立卫生院提供的PubMed检索系统(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/)、由广告商提供的HEALTHGATE检索系统(http://www.healthgate/medline/search.html)和MEDSCAPE检索系统(http://www.medscape.com/misc/formmedlineinflive.html/)、HELIX检索系统(http://www.helix.com)、MEDEC检索系统(http://medecinteractive.com/)等、AVICENNA检索系统(http://www.avicenna.com/)等。其中PubMed数据更新快，检索系统比较完善，深受广大医务工作者和图书情报人员的欢迎。但由于不少使用者不熟悉PubMed的使用方法，因而不用或少用，即便使用，检索结果也不太满意。本文拟简要介绍PubMed及其具体操作方法。
1 u2 B( `0 c! V2 w3 f) G　　PubMed检索系统所提供的书目信息数据库主要来源于MEDLINE和PREMEDLINE。其中PREMEDLINE是指将要进入MEDLINE数据库的文献先做成一个数据库，数据为每天更新。PubMed提供了强大的技术支持。使用户可以非常容易地在普通检索界面进行检索(普通检索界面可通过布尔逻辑组配执行高级检索界面的功能)。

/ `0 ?" @" T; H" z/ R- t; o- j7 K1　主题检索
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　　在检索式提问框中输入一个或更多的词，然后按回车键或用鼠标点击`search'按钮，PubMed就会利用`自动词语匹配'功能将重要的词或词组用`AND'组合在一起进行检索。当然，也可使用MeSH/副主题词组配格式(MeSH为Medical Subject Headings的缩写，是美国国立医学图书馆编写的医学主题词表)，如neoplasms/diet therapy［mh］**。“自动词语匹配”是检索系统将输入的检索词根据MeSH注释表、期刊名注释表、常用词组表和作者索引进行匹配。
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1.1　MeSH注释表
5 g) M/ r% d. o& x( c) @/ L) M
6 g3 V" a. D) {& I; d) c/ p7 S5 h　　MeSH注释表包括MeSH词、副主题词、MeSH词相关参照(也称款目词)、物质名称、物质名称同义词等。如果输入的检索词在注释表中发现有匹配的词，则该词将被作为MeSH词和自由词(即textword)同时进行检索。例如，如果我们输入Vitamin h,PubMed会这样检索：(“Biotin［MeSH］OR itaminh［tw］)——vitamin h是MeSH词Biotin的款目词。
1 Q# a, r% H3 \6 d! |2 a  G
# U0 m7 B( l* N  i0 L/ }1.2　期刊名注释表
6 H! F( `5 `+ V
9 |) L" S1 H  C4 \1 |5 h# j2 I　　包括期刊名全称、期刊名MEDLINE缩写、ISSN号。例如，如果你输入“New England Journal of Medicine”，PubMed将按“N Engl J Med［ta］”查询。

$ |' P1 Z! \* M& h1.3　常用词组表
5 O* h& C) {  S! M# E
　　如果在MeSH注释表或期刊名注释表中未发现匹配的词，PubMED就会检索来自MeSH、物质名称、题名和文摘中多次出现的常用词组表，例如cold compresses。
5 j8 l+ R% c- }2 b* n$ H
$ w% W. o8 P2 U- |1.4　作者索引

7 i! H7 Z% p: R" v　　如果输入的检索词在以上词表中未找到，且该词后有一或二个字母，PubMed就会查检作者索引。如果在作者索引中仍未找到匹配词，PubMed就将该词组分开并重复上面的查找过程。如果还没有匹配词，PubMed将该词组的每个单词用`AND'组配并在所有字段中查找。
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2　作者姓名检索

　　输入作者姓名时应采用姓+名(名的首字母缩写，不用标点符号)的格式，例如SmithJA。PubMed将自动地截取作者姓名中名的首字母以适应不同的名缩写。如果只输入作者的姓，PubMed会在包括作者字段在内的所有字段进行检索，例如只输入Yang,则PubMed将象下面一样检索：Yin-Yang［mh］或Yang［tw］。此外，如果使用双引号“”将作者的姓全称和名的第一个首字母引起来，并用作者检索字段标识符［au］限制，如“smithj”［au］，PubMed将关闭自动截词，且检索姓名中名只有一个字母缩写的作者。
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3　期刊名称检索

" L5 Q: V5 G4 w- _& R3 o0 Q# F4 A　　可以输入期刊名全称检索，如molecular biology of the cell;期刊名MEDLINE缩写名称检索，如molbiolcell;或ISSN号检索，如1059-1524。
4 T, ~" T" D: @- I$ L　　如果期刊名称正好是医学主题词表(MeSH)中的词，例如genetherapy、science、cell,PubMed会将其当作MeSH词进行检索。因此，在此种情况下应使用期刊名称检索字段标识［ta］，如genetherapy［ta］。
: z* c: e+ `" s" S$ B3 s' V" M　　如果期刊名称是一个单词，也需要使用期刊名称检索字段标识，如scanning［ta］，否则会在所有字段检索该词。
　　推荐使用期刊名称全称或MEDLINE缩写形式检索期刊。同时需要注意的是，在以前的引文中，ISSN号是不能保证的。

4　截词检索
( }, B! u1 `7 I  T9 [5 s
  `% l. |; k( b: Q% R5 a* o　　在词的末尾加*号，PubMed就会检索出以该词为词根的所有词，例如，staph*，但不包括*号后有一个空格的词组，譬如，infection*包括infections，但不包括infection control。此外，截词检索将关闭自动词语匹配功能，也不能进行扩展检索。如：heart attack*不会匹配MeSH词，也不会扩展检索my-ocardial infarction、myocardial stunning、shock,cardiogenic这些方面的文献。

5　词组检索(规定PubMed检索一个词组)

) X# m0 a- U% N( k3 l1 ]　　如果PubMed检索在常用词组列表中已有的词组，如poi-son ivy,PubMed就会把它作为一个词组来检索。但有时Pubmed可能找不到相应的词组，如brca1，此时可通过给一个词组加上双引号，使得PubMed将其当作一个词来进行检索，如“brca1”。需注意的是，使用双引号规定PubMed进行词组检索，PubMed就不会执行自动词语匹配功能和扩展检索功能。
2 T$ t+ X6 X0 n1 ^! a5 s+ C$ ?
( Y' Z& @+ g6 a9 w7 j8 a6　每页显示的文献数量
9 B& ?! L* N! q! }% ]
7 }! r, B, C  d; S, ^　　PubMed将检索出的文献记录按每页20条显示(缺省值)。要改变缺省值，单击`number of documents to display perpage'下拉菜单，并选择一个更大的值。

4 R4 S* E$ [0 {. L6 N* u/ t7　检索时间范围限制
4 ^' o2 k% i4 e, a# ]# e# t
0 B: R# I+ |5 d$ ?) i* X! b　　使用`entrez date limit'下拉菜单可限制检索时间范围。`entrez date'是引文追加到PubMed数据库的日期。引文以文献记录入库时间顺序显示(倒序)。
3 r" }/ \7 B3 x9 }: X/ @
' c0 S% U# M) @- \8　检出文献记录显示格式
0 @$ i  v$ c# f0 s! E8 v8 A# I2 ?
　　使用“abstract report”(PubMed缺省显示方式)下拉菜单可选择文献记录显示形式。
- n, R3 a, @% C2 m5 X5 f0 F- z( N5 [　　①文摘报告：包括期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有)、出版类型、PubMed和MEDLINE登记号等。
　　②引文报告：期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有)、出版类型、MeSH词、资助号、PubMed和MEDLINE登记号等。
* o2 }3 B! l* A) U" j9 v, I2 j' ?　　③MEDLINE报告：MEDLINE记录格式，采用二个字母的文献记录字段标识符。

3 q$ a& m2 u. [! I: B9　PubMed检索规则与语法

　　①布尔运算符AND，OR，NOT必须大写，例如，vitaminc OR zinc；
8 P% b" K1 v0 O. y- j; g　　②PubMed从左至右进行布尔运算。不过，你可以通过加圆括符改变运算顺序，如commoncoldAND(vitamincORzinc)。
0 c2 D* Y0 q4 |. L+ Z1 Y　　③指定文献记录字段名称检索，如dna［mh］ANDcrick［au］and1993［dp］。下面列出常用字段名称缩写：
' w! I. z) b- U  m& T) e: N6 F　　DP——出版日期　采用YYYY/MM/DD［DP］格式，如1998/03/06［DP］。输入日期范围则用冒号连接，如1996：1998［DP］，1998/01：1998/04［dp］
" L- e0 p% @  f　　AD——第一作者机构名称、地址、资助号　如LM05545/LM/NLM［ad］
　　AU——作者姓名　如o'brienj［au］
/ Q8 U4 k$ ?* q$ C6 I　　TA——期刊名称　包括期刊名全称、简称、ISSN。jbiolchem［ta］或0021-9258［ta］
7 {! Y  E$ s6 r9 |7 f5 D# o　　LA——文献出版语言　Chinese［la］
　　MH-Mesh主题词　neoplasms［mh］或neoplasms/dt［mh］
　　PT——出版类型　review［pt］
% T5 i' {9 p0 p  t* a) Y( D. ~6 J　　TW——自由词　AA001794［tw］
8 E. K7 o7 }8 {6 I7 H; p; b　　T1——文献标题内自由词leiomyosarcoma［ti］
　　④经常通过单击Details按钮观察PubMed怎样运算你的检索策略，并不断修正检索策略，以达到最佳检索结果。
10　PubMed在提供的文献记录中，有些记录中出现有彩色标记的期刊名称缩写按钮，用鼠标点击该按钮，部分期刊将免费提供该记录的全文。