【推荐】pubmed 检索具体操作方法

高塔

近年来，随着INTERNET的普及，一些机构通过INTERNET提供MEDLINE数据库免费检索服务，如美国国立卫生院提供的PubMed检索系统(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/)、由广告商提供的HEALTHGATE检索系统(http://www.healthgate/medline/search.html)和MEDSCAPE检索系统(http://www.medscape.com/misc/formmedlineinflive.html/)、HELIX检索系统(http://www.helix.com)、MEDEC检索系统(http://medecinteractive.com/)等、AVICENNA检索系统(http://www.avicenna.com/)等。其中PubMed数据更新快，检索系统比较完善，深受广大医务工作者和图书情报人员的欢迎。但由于不少使用者不熟悉PubMed的使用方法，因而不用或少用，即便使用，检索结果也不太满意。本文拟简要介绍PubMed及其具体操作方法。
; I- [" k6 J' p6 K2 {　　PubMed检索系统所提供的书目信息数据库主要来源于MEDLINE和PREMEDLINE。其中PREMEDLINE是指将要进入MEDLINE数据库的文献先做成一个数据库，数据为每天更新。PubMed提供了强大的技术支持。使用户可以非常容易地在普通检索界面进行检索(普通检索界面可通过布尔逻辑组配执行高级检索界面的功能)。
6 R) ?9 |9 D  F$ O
1　主题检索

　　在检索式提问框中输入一个或更多的词，然后按回车键或用鼠标点击`search'按钮，PubMed就会利用`自动词语匹配'功能将重要的词或词组用`AND'组合在一起进行检索。当然，也可使用MeSH/副主题词组配格式(MeSH为Medical Subject Headings的缩写，是美国国立医学图书馆编写的医学主题词表)，如neoplasms/diet therapy［mh］**。“自动词语匹配”是检索系统将输入的检索词根据MeSH注释表、期刊名注释表、常用词组表和作者索引进行匹配。
7 [7 s0 R6 |- \. M$ q
1.1　MeSH注释表

+ m6 y8 V, n, P$ N1 p, k/ B% H6 w6 w　　MeSH注释表包括MeSH词、副主题词、MeSH词相关参照(也称款目词)、物质名称、物质名称同义词等。如果输入的检索词在注释表中发现有匹配的词，则该词将被作为MeSH词和自由词(即textword)同时进行检索。例如，如果我们输入Vitamin h,PubMed会这样检索：(“Biotin［MeSH］OR itaminh［tw］)——vitamin h是MeSH词Biotin的款目词。

1.2　期刊名注释表

! D! h8 G6 s$ S" D　　包括期刊名全称、期刊名MEDLINE缩写、ISSN号。例如，如果你输入“New England Journal of Medicine”，PubMed将按“N Engl J Med［ta］”查询。
7 p" ~/ g, H& |6 [1 |! \" Q2 v
1.3　常用词组表

　　如果在MeSH注释表或期刊名注释表中未发现匹配的词，PubMED就会检索来自MeSH、物质名称、题名和文摘中多次出现的常用词组表，例如cold compresses。
7 n$ c# F1 M& g9 {0 n( W
1.4　作者索引

　　如果输入的检索词在以上词表中未找到，且该词后有一或二个字母，PubMed就会查检作者索引。如果在作者索引中仍未找到匹配词，PubMed就将该词组分开并重复上面的查找过程。如果还没有匹配词，PubMed将该词组的每个单词用`AND'组配并在所有字段中查找。
# u; L3 b# M" [. r& H7 F0 M
1 @4 O- Y" I+ a0 E, |. |2　作者姓名检索

　　输入作者姓名时应采用姓+名(名的首字母缩写，不用标点符号)的格式，例如SmithJA。PubMed将自动地截取作者姓名中名的首字母以适应不同的名缩写。如果只输入作者的姓，PubMed会在包括作者字段在内的所有字段进行检索，例如只输入Yang,则PubMed将象下面一样检索：Yin-Yang［mh］或Yang［tw］。此外，如果使用双引号“”将作者的姓全称和名的第一个首字母引起来，并用作者检索字段标识符［au］限制，如“smithj”［au］，PubMed将关闭自动截词，且检索姓名中名只有一个字母缩写的作者。
3 D; ~! b- ?  T6 [8 S4 P, @
! P$ K  n( Z! B4 Y6 o& I3　期刊名称检索
( n% }6 @- j( p
　　可以输入期刊名全称检索，如molecular biology of the cell;期刊名MEDLINE缩写名称检索，如molbiolcell;或ISSN号检索，如1059-1524。
8 H5 S# K( X8 f( O- s, i1 ?( @& ?　　如果期刊名称正好是医学主题词表(MeSH)中的词，例如genetherapy、science、cell,PubMed会将其当作MeSH词进行检索。因此，在此种情况下应使用期刊名称检索字段标识［ta］，如genetherapy［ta］。
8 K  G6 a% N% m6 x4 j9 M  Y: L9 i　　如果期刊名称是一个单词，也需要使用期刊名称检索字段标识，如scanning［ta］，否则会在所有字段检索该词。
　　推荐使用期刊名称全称或MEDLINE缩写形式检索期刊。同时需要注意的是，在以前的引文中，ISSN号是不能保证的。
. @8 F% B( M: ]4 }$ K
/ \7 p$ u+ ~& ^4 {2 ~6 s" Q4　截词检索
( G6 m* c+ D) L, d9 M. O
/ B- D# e; ~! J; I2 Y　　在词的末尾加*号，PubMed就会检索出以该词为词根的所有词，例如，staph*，但不包括*号后有一个空格的词组，譬如，infection*包括infections，但不包括infection control。此外，截词检索将关闭自动词语匹配功能，也不能进行扩展检索。如：heart attack*不会匹配MeSH词，也不会扩展检索my-ocardial infarction、myocardial stunning、shock,cardiogenic这些方面的文献。
7 ?4 W8 r5 p& k* w$ }
4 h7 ?7 L7 G6 b& `7 \2 D/ S6 ^+ F. E2 h5　词组检索(规定PubMed检索一个词组)

4 @" E5 F( W0 p8 L　　如果PubMed检索在常用词组列表中已有的词组，如poi-son ivy,PubMed就会把它作为一个词组来检索。但有时Pubmed可能找不到相应的词组，如brca1，此时可通过给一个词组加上双引号，使得PubMed将其当作一个词来进行检索，如“brca1”。需注意的是，使用双引号规定PubMed进行词组检索，PubMed就不会执行自动词语匹配功能和扩展检索功能。
8 n" v/ f5 ~- \0 \0 R
6　每页显示的文献数量
' Y" h: n# Q1 o+ C/ D! W' r2 ?
　　PubMed将检索出的文献记录按每页20条显示(缺省值)。要改变缺省值，单击`number of documents to display perpage'下拉菜单，并选择一个更大的值。

7　检索时间范围限制

( X, d$ R# w# p6 e5 x2 ?$ @, H　　使用`entrez date limit'下拉菜单可限制检索时间范围。`entrez date'是引文追加到PubMed数据库的日期。引文以文献记录入库时间顺序显示(倒序)。

% k( o) g; ~% R3 o' g% n; E8　检出文献记录显示格式

　　使用“abstract report”(PubMed缺省显示方式)下拉菜单可选择文献记录显示形式。
　　①文摘报告：包括期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有)、出版类型、PubMed和MEDLINE登记号等。
　　②引文报告：期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有)、出版类型、MeSH词、资助号、PubMed和MEDLINE登记号等。
　　③MEDLINE报告：MEDLINE记录格式，采用二个字母的文献记录字段标识符。
+ i- }) z( ^, q/ l/ r: L* i
/ U5 {' ]6 [4 s1 l8 V9　PubMed检索规则与语法
; n% v3 L: Z/ I: b' A' E
% ~$ k( U; J7 s' ?6 ^: i! q  f# V2 I& q　　①布尔运算符AND，OR，NOT必须大写，例如，vitaminc OR zinc；
3 z' E4 O. ?% l; C　　②PubMed从左至右进行布尔运算。不过，你可以通过加圆括符改变运算顺序，如commoncoldAND(vitamincORzinc)。
　　③指定文献记录字段名称检索，如dna［mh］ANDcrick［au］and1993［dp］。下面列出常用字段名称缩写：
$ I# ~* w/ v2 I& ?　　DP——出版日期　采用YYYY/MM/DD［DP］格式，如1998/03/06［DP］。输入日期范围则用冒号连接，如1996：1998［DP］，1998/01：1998/04［dp］
( ?: Q7 W" M/ w. Q　　AD——第一作者机构名称、地址、资助号　如LM05545/LM/NLM［ad］
　　AU——作者姓名　如o'brienj［au］
- k& V$ g- ?* u$ K( b4 ?) P　　TA——期刊名称　包括期刊名全称、简称、ISSN。jbiolchem［ta］或0021-9258［ta］
) k2 C; w* W+ n( R　　LA——文献出版语言　Chinese［la］
( L" ]1 D) u  C" {: ~. G" d　　MH-Mesh主题词　neoplasms［mh］或neoplasms/dt［mh］
　　PT——出版类型　review［pt］
　　TW——自由词　AA001794［tw］
　　T1——文献标题内自由词leiomyosarcoma［ti］
　　④经常通过单击Details按钮观察PubMed怎样运算你的检索策略，并不断修正检索策略，以达到最佳检索结果。
$ S" V  ^+ |: E" H. i10　PubMed在提供的文献记录中，有些记录中出现有彩色标记的期刊名称缩写按钮，用鼠标点击该按钮，部分期刊将免费提供该记录的全文。