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发表于 2006-8-19 17:15:18
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一些生物医学方面的。国内跟国际不是一个档次，就不作介绍了。
( A. N' [; [9 {核酸資料庫與分析工具 蛋白質資料庫與分析工具 其他資料庫與分析工具
. R' J, \; ~: G6 W+ x一、生物学常用网址：
! T. n4 e5 e7 s
u1 q* k# g. G CMS MBR 生物网站 http://www.cbi.pku.edu.cn/srs5bin
) B. C! c$ M4 N1 Y% [6 o8 m pubmed医学文献检索 http://www.ncbi.nlm.nib.gov/PubMed/medline.html 7 K! e& M9 T! L$ O2 }
HighWire Press http://intl.highwire.org/
" `" }) l" L' ^; i5 Z, C$ U2 \( X) g3 t* y' p# O e
Elsevier Science电子期刊 ' {- y" q) I" g( W+ R- j5 l
http://www.ddbj.nig.ac.jp/>
& Z: f1 x, V$ L, J4 D1 ] http://www.lib.tsinghua.edu.cn/NEW/elsevier.htm ) u1 Z# m2 w* E; }3 e* r8 R
science online国内镜像 http://china.sciencemag.org/
' r- z" s6 j7 g2 a* i$ K0 B9 x6 O 上海生化所：http://www.sibc.ac.cn/
3 c6 m2 L& W, b3 q/ z4 u 中国微生物信息网络http://www.im.ac.cn/chinese/chinese.html
. Z& {; F! X u/ G2 L Cell杂志 http://www.cell.com/
. |- s5 g# q) l/ W( e7 D/ m, @3 i 中文科技期刊 http://www.chinainfo.gov.cn/periodical/index.htm
% i6 |- X6 Z) ~5 o$ K4 \ 国家自然科学基金委员会 http://www.nsfc.gov.cn/ / l$ t1 {' x- i: Z8 Q+ v7 Z7 Z$ R
网上全文的生物学期刊http://dna.sibc.ac.cn/bio/journal.htm
+ Z" L: J' K5 Y& e+ I" F8 ~ Science期刊网址：http://www.sciencemag.org/ (免费）
0 o8 F0 U6 ^# A6 }+ E$ b 美国科学院院刊PNAS网址：http://www.pnas.org/(免费） 6 L* u/ A! t+ Q4 J
) O' t) [' j( K: u美国生物技术信息中心(NCBI)
/ h7 F% L$ R! Z/ B5 Fhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov" |! i1 K4 l2 `
核酸序列数据库主要有GenBank（www.ncbi.nlm.nig.gov/genbank/）、EMBL（http://www.ebi.ac.uk/embl/）和DDBJ（http://www.ddbj.nig.ac.jp/）
+ F' ~3 X6 q. f6 ?8 X3 }' e& J4 i# x: {. J
9 }7 g: }/ A. Z2 h! ?! v2 _蛋白质信息资源(PIR)* _" A8 r" ]. T# |) R: @' e
http://www.gdb.org/Dan/proteins/pir.html
6 D2 S4 D L* L4 D- Q. Z# j; O+ k$ m* K H- C" `! ?; E0 R0 _/ `
[# S3 {$ p: W+ C4 O# U
蛋白质结构数据库(PDB)& ~; Z+ e7 M3 Q3 l# A
http://www.rcsb.bnl.gov/
( L. M+ W- j E( a1 i) D5 k$ f. c. _" ?! y, D& h1 q
Sander蛋白质二级结构数据库
: U7 G) M$ G$ R9 K5 x6 }http://www.sander.embl-heidelberg.de/
& R1 K2 D. w7 P- n7 b" {! E( H
" X$ ]) ^+ Q+ x. \$ N/ ^% A D7 O# d( JSNP数据库
+ _- }/ M+ ^+ i# r5 B数据库 数据库说明 网址3 C9 f4 K. S, a
HapMap International HapMap
# m8 Q, M- B; \7 b! fProject data http://www.hapmap.org/index.html.en
7 C: G6 ?1 Z' [0 \% z$ NdbSNP Human Single Nucleotide
+ O1 @- V, Z. \) ]3 iPolymorphism Database http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/
( [ Z3 V" Z4 g' X' r& x- bHMGD Human Gene Mutation! k. `2 L' W( l( Z4 m* R3 K
Database http://archive.uwcm.ac.uk/uwcm
) a0 }7 s3 E0 Z: o/mg/hgmd0.html
2 ^. x3 x! P8 J4 ~% o- U7 t; qJSNP A database of Japanese
8 K$ X3 [$ \; G4 P6 ^Single Nucleotide Poly-0 W. D! P3 s9 x) F# s3 d8 A" l
morphisms http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/
3 W' { y4 {2 `1 P; n8 B" RSVD Sequence Variation
1 z0 E% C: M) x' s. jDatabase http://www.ebi.ac.uk/mutations/
5 O$ a/ O( z9 b3 x, W& ]7 G0 \ ?9 n) \HGVbase Human Genome6 P% |- x3 p' c: \' E8 c
Variation Database http://hgvbase.cgb.ki.se/. j( `2 n+ \ n) j9 m+ L1 z. B R
Human SNP Database Human SNP Database http://www-genome.wi.mit.edu/SNP/ human/index.html
/ O' {; \1 `" _! u" u" JGeneSNPs Environmental Genome
9 ]; m6 Q/ g8 {$ b+ Z/ A6 b( fProject database http://www.genome.utah.edu/genesnps/
% k. W9 Y; t; K+ W9 x
4 n* z7 v" q: s2 N+ q. X6 I
: C8 u0 a9 o/ A# Z6 `, a, V- G尽管现在3p87/3p97不是最好的药代动力学处理软件，但好多人还在用。8 ?( ]# m! ]4 a4 F# F
下面贴一个使用说明供新手参考。
$ E8 t& a/ P% v; C F7 {9 N. @8 |2 A3 l4 `% t, N D
"3p87"(新版)使用说明 ' N' \4 t$ G( F/ o
* @: }* o( \; @* A+ U2 Z6 w
一. 基本要求
9 l! q1 o5 L% r! R" P( K- p8 U/ _$ C1. 在合理的取样设计基础上, 对于非静脉注射给药, 一室模型不少于五个, 二室 模型不少于八个, 三室模型不少十一个不同时刻的血药浓度数据. 对于静脉推注给药和静脉滴注给药滴完药以后, 一室模型不少于四个, 二室模型不少于五个, 三室模型不少于九 个不同时刻的血药浓度数据. 1 y/ q& ?, d* K, ]1 @2 ]4 d
2. IBM-PC 及于其兼容的各种型号微机, 英文 DOS 操作系统, 打印机.
( e. B g) ~; i% l( c二. 调用 3P87 程序前的准备工作 6 B" s8 V3 g8 b3 Q6 ^7 j
1. 确定主数据. 如果一个剂量组有几个个体, 主数据是指浓度数据的均数或中位 数, 或用户认为最具代表性的浓度数据. 一般来说, 对静脉注射给药的数据用均数或中位数比较合适, 对于非静脉注射给药可考虑用实测点多的数据为主数据. 目的是在计算个体数据时, 可参考主数据的计算结果, 选定房室数和权重进行计算. - U ~2 g; o( H% B, |' _* W4 g
2. 打印曲线图形的准备工作. 见文件 DQX.TXT 可用打印机打印出来, 即执行命令 PRINT AQX.TXT ! L% I" Z# k: k" m/ p
三. 调用 3P87 + i- y+ Z; ?; R- Y
将 3P87 程序盘放入 A 驱动器, 键入 A:3P87 并回车,即显示程序首页, 再按任意键, 显示出程序主菜单:
1 e0 \7 d: n4 l/ b" r( X ]; e [( u/ ~主菜单
. i; O+ C7 g6 I7 n- n1. 输入或修改数据
; m+ b& O- a! x8 u! r/ f2. 用主数据计算药代动力学参数
* R- P: h& Q1 B a& e" ?' K k3. 对多组数据进行批处理计算 0 w( i! v/ i7 _: u
4. 由用户指定算法和条件计算药代动力学参数
* ~8 {0 l/ y) D7 U( _: @ u5. 输出计算结果 3 ]/ t3 \+ B) k" [
6. 用简化系统计算药代动力学参数
- D1 ]6 C- l$ w% X6 `% D" `" P7. 药代动力学房室模型的图示和说明
5 Y! m2 ^( K: `3 L1 `& k8. 退出 3P87 程序 3 `( c. G& q- e2 m1 g4 B% B
四. 输入或修改数据 9 J$ }2 A" f5 Q
在屏幕出现程序主菜单后, 键入数字 1 屏幕左上角显示出 2 {% h( h1 i$ g8 d3 w
Please Execute a:inp
# P2 x: Z# Q0 x- t& T" e. c5 [键入 a:inp 并回车, 屏幕显示出输入菜单: 1 ] F7 {# r: T' L1 U5 n' k
输入菜单 / S7 i0 k8 }: o* }
1. 输入数据
5 i5 ~. o1 \# e2 A6 l" c' S4 U/ R2. 修改标题文件 ; v D! c5 l' Y3 D' b, w/ H c
3. 修改浓度--时间数据
7 X8 q4 O4 v, N0 r, n1 T1 B8 D: H: E4. 增添浓度--时间数据
+ S0 `$ x2 o' B5 e! A# i5. 删除浓度--时间数据 * B K( m% H% U6 d6 s0 x* ?
6. 显示输入的数据
3 s# f4 r4 m- l! {7. 打印输入的数据 1 H& A8 W# T1 g0 \6 M" `
8. 返回主菜单 0 I# r, \* d" O) o3 o5 b1 r, K
1. 输入数据 , c4 s2 n& Q; w+ Y. [
1.1 建立标题文件
- `. l. p9 h. d3 m在屏幕显示输入菜单后, 键入数字 1 即显示出标题文件中需要输入的内容: ' h3 U# m+ c4 D* B* m, I- d/ S
1. 药名或文件名
! f$ E' E3 y$ x2. 实验对象 3 c& B" c* I& I0 d! N
3. 研制单位
! A! n8 C! U( I: d8 N* Q# n' V4. 日期
+ s/ Y4 J6 \* r4 X! `2 j5. 实验者 1 O, d# N4 {( x8 X
6. 计算者 . a+ C" Q3 y. A! q: P8 u3 Y
7. 测定灵敏度
' e, G" P. ~ P+ S, y D! x8. 浓度单位
. H+ a n0 R! A& {! k. f9. 测定精密度(cv%)
$ R# {, b3 ]/ T& ?$ N( v' H10. 时间单位
) @* H9 V+ c- ?2 E3 q2 Y11. 给药剂量单位
! U) `/ A7 x6 ?& ^( X& q用户按光标提示项目逐项输入之, 其中 1. 8. 10. 11. 项与实验记录和计算 3 D- Y( N/ x/ x1 s. s
有密切关系, 必须输入. 每输完一项(数字或文字)都要按回车键(ENTER 键). 当全部项目 % O2 X- ` d8 K4 D/ I) w" v
输入完后, 屏幕重现标题文件全部内容, 同时询问用户是否需要修改, 如不修改, 按回车
0 S/ q, ?! N6 q. p* q键后向用户提问是否确认 Are you sure(Y/N)? 如确认按 Y键, 程序进入下一步; 如需修 3 {! J4 B+ K) c! }5 b6 |& i( P3 {
改, 按 N键, 再用四个箭头编辑键, 把光标移到要修改处进行修改, 每修改完一项必须按
) R4 |5 ^2 R, e: } ]* {5 U回车键. 当全部项目正确无误后, 再按上述方法进入程序下一步给药途径的输入. - t B& L" s* V6 L7 K# M
1.2 输入给药途径 屏幕显示出三种给药途径 ' T$ y6 @& Y4 S$ b7 w" m; S
1. 静脉推注
/ Q6 E8 w% _& Z. s' @! W2. 静脉滴注 7 `) T4 J# \' H9 R" F+ D8 {
3. 非静脉给药 8 J1 ?; I' ]$ e
用户按相应数字键选定给药途经后, 程序进入下一步剂量组数的输入. * ]) C* Y; V2 ?
1.3 输入剂量组数 用户按相应数字键后, 程序进入下一步输入各剂量组的个体
F, J2 ^. E$ Z; G1 B数目, 剂量和静脉滴注时的滴注时间.
0 l O2 s6 D! z' A* N Z1.4 输入各剂量组的个体数目, 剂量和静脉滴注时的滴注时间. 1 r) {& @2 v% k- E6 W
用户按光标提示项目逐项输入相应数据. 每输完一个数据都要按回车键. 当 $ L, j! D& h: d3 a9 N- ?2 E, s7 l0 T
全部数据输完后, 亦可用四个箭头编辑键, 把光标移到要修改处进行修改, 每修改完一项
7 j! M& d6 C" A4 D' [, M必须按回车键. 当正确无误后, 按回车键进入程序下一步输入浓度--时间数据.
& r( E4 j1 t/ t2 _$ K2 G4 g+ Y3 l1 T- D
* 当上述数据输入完成后, 程序自动以用户输入的药名或文件名中前八个英文字母加 4 ~0 U' ~. K$ s& |1 i: L) a
后缀 .TIT 形成标题文件, 存入当前盘, 以后可随时使用. ; Z3 ~: V( g, Y$ X
1 q; c6 j% e- w I
1.5 输入浓度--时间数据 + D' F( U0 s- |$ U
先输入各剂量组的主数据, 供选择模型, 算法, 权重用, 然后输入各剂量组 ( [" J( b. r1 i4 q4 t9 B7 l
内各个体的浓度--时间数据. 如用户想对每个个体都逐一计算各种模型, 可将个体数据按 2 O; t' o' ^# u, ~/ e* M8 j# w
主数据输入.
/ N( Q# c! ~4 q在输入浓度--时间数据时, 屏幕上显示出当前要输入的数据的序号(Data No
3 b9 [$ A" s: s" f" G! z.), 主数据号(Main *)或个体序号(Subject * *), 给药途经(Route of Administration),
8 e# Z. X# N- u1 {3 I4 \6 P. P剂量(Dose); 并询问该组数据的点数(Number of Pairs), 按相应数字键和回车键回答之.
$ e7 W2 K4 I) y9 C3 R0 N用户根据屏幕提示的剂量组号, 个体号, 光标指示的时间或浓度位置, 依次
# ^( d( i4 a0 u+ j6 J输入相应数据. 每个数据输入后都要按回车键. 全部数据输完后, 屏幕重现全部输入内容
) }; s; W$ ?9 `9 Q0 _# j, 按回车键, 经确认后记入当前盘, 或用四个箭头编辑键, 把光标移到要修改处进行修改 6 _4 J6 w/ y4 P0 X# P
, 每修改完一项必须按回车键. . L* b- S1 i: i1 F
1 I1 ], h: K+ y( Z* 输入完所有浓度--时间数据后, 程序自动以用户输入的药名或文件名中前八个英文 # o1 f8 U3 I/ c0 E) S' A" X" a
字母加后缀 .INP 形成浓度--时间数据文件, 存入当前盘, 以后可随时使用. " K8 a; T7 a! G3 O* h/ m
2 O" P' v8 P) Y3 P
2. 修改标题文件
* A4 l5 O5 p Z) n# J在屏幕显示输入菜单, 按数字键 2 后, 屏幕显示询问要修改的文件名(药名), - l! ?( }4 ^ j7 b
键入文件名后, 屏幕重显原标题文件的全部内容, 用四个箭头编辑键, 把光标移到要修改 3 {, z8 T6 U) V3 S, |1 s
处进行修改, 其方法和输入标题文件时一样. . e" d9 o6 V$ j: ~! n/ w
3. 修改浓度--时间数据 ' P) B% ^1 c2 B+ S) Q& J
在屏幕显示输入菜单, 按数字键 3 后, 屏幕显示询问要修改的数据序号(Dat 9 T6 ? a U. N9 C: }( n) l0 ]+ R
a No.), 键入序号后, 屏幕重显该记录号的全部内容, 用四个箭头编辑键, 把光标移到要
" g0 ]6 e' L2 d! m5 K修改处进行修改. 修改的内容可以是浓度--时间点的个数, 时间值, 浓度值. 每修改完一 2 S2 q g0 Z$ R( Z( e
项必须按回车键. 其方法和输入浓度--时间数据时一样. , }. @. w' a% {0 M. y
4. 增添浓度--时间数据 ! n5 a9 g9 g- |' h0 i4 T* k
在屏幕显示输入菜单, 按数字键 4 后, 出现增添数据菜单:
" a0 [3 Z: V; _3 G, Y" @# s1. 增添新剂量组 1 q8 e0 t4 Z2 X- B: H
2. 在某剂量组内增添个体数据 9 I+ _2 D# E- D, b
3. 返回输入菜单 `; Q, |1 O7 S8 A% b$ n
按数字键或 1 或 2 或 3, 完成相应的工作.
3 c; K S* l0 l1 W0 [3 X0 B7 C4.1 增添剂量组
7 S7 n% k2 p, U G2 \4 f+ |: M" o屏幕显示输入文件结构, 询问是否要增添 Append(Y/N)? 要增添则键 Y ,然 # h4 Z. o. L7 B* ?* \
后询问要增添的组数(Number of Group to be Appended), 用户输入组数并得到确认后, 1 Z) n* Z3 s! E! _* P
屏幕重现剂量组别, 个体数, 剂量, 静脉滴注时间的结构, 光标停在准备增添的地方, 用 0 r" _( M0 U0 m
户根据提示, 顺序输入剂量组的个体数, 剂量, 滴注时间. 其方法与开始输入时一样. % ?" V9 g% b$ L( q5 W( t$ n. u' z% X
4.2 在剂量组内增添个体数据 7 l4 M2 y' n9 Z
根据询问回答要增添的剂量组号(Data will be Appended to Group No.)和
: y1 ]% [7 M, H新增添的个体数(Number of Subjects to be Appended), 随后按提示顺序输入时间--浓 5 V* o+ ]9 c4 I* z
度点数, 时间和浓度数据, 方法与前述相同. 4 N, D+ k' r) u' K
5. 删除浓度--时间数据 , f/ s% Z: H' `* z5 S
在屏幕显示输入菜单, 按数字键 5 后, 出现删除数据菜单:
- q6 ~: o2 d0 x/ [4 |1. 删除一个剂量组的全部数据 2 V2 F: x5 m3 C$ b; B
2. 删除一个剂量组中的一个个体数据
; @' E* k$ D1 T, G% M3. 返回输入菜单
" Q$ H8 J K" K5 _) i- J按数字键或 1 或 2 或 3, 完成相应的工作. 2 }/ t W; B" w- o3 n. _
5.1 删除一个剂量组的全部数据
7 `2 W* k8 \( w5 l; X屏幕首先要确认是否要删除 Delete(Y/N), 在确认后, 询问将要删除的剂量
- l g! s" ~! \& Z; z组号(The Group No. to be Delete), 用户键入剂量组号, 还要再次认可(Group ** will 6 n3 i# |; _ ]. y
be Deleted Are You Sure(y/n)?)后, 程序删除该剂量组全部数据, 包括主数据, 个体数
" o1 U/ G1 B& a/ v3 g据, 并按新的结构重排一次数据. 9 u* h+ h0 B) }3 Z' H0 x
5.2 删除一个剂量组中的一个个体数据
1 m, `1 X1 h3 r" w根据屏幕显示的数据序号(Data NO.),剂量组号(Group)等, 回答准备删除的 ; C" L: c: ?/ i$ T! O, k2 L3 t
数据序号(Please Input the Data NO. to be Deleted?)后, 该序号的数据即被删除.
% m& ?6 q6 h0 u* C
, A) R$ k: P4 m" Q: g* 增添或删除记录将要改变整个文件的结构, 使标题文件中的剂量组数, 组内个体数
$ ^1 K) U. Q$ W8 ~* `: l& `+ m, 剂量和滴注时间, 以及输入和输出文件记录顺序都必然发生相应的变动. 为此建议用户
' {* }7 W# |& L1 Y% W# G( l在此前, 应首先复制一份原文件作备用. : O' K, ^3 z3 W/ R$ i: @
8 ?# W0 C4 k3 D1 a9 o) s5 a6. 显示或打印输入文件
" L" u; }8 l- ~; @% Q在屏幕显示输入菜单, 按数字键 6 或 7 即可显示或打印输入文件内容, 用户
+ b6 e# R3 M2 I: F' @从该内容可以了解数据排列顺序, 便于修改核对, 这对于指定数据号进行计算也非常有用 9 b5 `1 V u& U1 r, h5 {
. 其顺序是按剂量组顺序排列的, 先按主数据序号排列, 再按个体顺序排列. 用户可自如 ( E4 _8 T! `) a9 j( {9 V
调用有关记录.
) h5 b& N1 k; o8 p) y4 @4 V
) w' I7 N) l% E% o五. 计算药代动力学参数
+ u) @" I' j0 F在屏幕出现程序主菜单后, 键入数字 或 2 或 3 或 4 即可进行药代动力学参数 ; y) D$ X5 D' \) k+ e( x1 R$ d& U) t
计算. 此时屏幕左下侧有一对话区, 用户应回答其中的提问. 为防止误答, 在键入回答后
! @: o$ O3 M/ C/ \3 U+ k! I0 U. P要求再确认 Are you sure(Y/N)? 键 Y 表示确认无误, 就进行下一步. 计算时屏幕分成
, ~- H) n+ Z# D! c& Y3 g左右两栏, 左栏显示出数据号, 模型号, 房室数, 给药途经, 计算方法, 权重, 收敛精度
' _, q, r7 K9 U a, 迭代次数(No. of iterations), 残差平方和(Sun of Squares) 等. 右栏显示出正在计 5 U2 r, `2 z. @; T3 r5 A* ]/ t6 b
算的血药浓度--时间数据. 屏幕左下侧的对话区显示出 "CALCULATION Please Waiting"(
) H5 T- ~2 R: j正在计算, 请等待). 计算完毕后, 不显示或打印结果, 而是将全部结果存入当前盘, 用 M. N% n+ b ?! w
户可随时调用, 调用方法见后面六. ' x D. |) E- S" R5 F$ c
1. 用主数据进行计算 d5 U7 m& ?0 B6 S, l4 o8 [
在屏幕显示主菜单后, 键入数字 2 屏幕显示出: "AUTO COMPUTATION"(自动计
M! q. M, ^5 j, n6 e算). 对自动计算, 对话区只提问文件名. 计算时, 程序首先判别正在计算的数据是符合
3 M: \3 a% U. Z% c/ F4 Z线性还是符合非线性动力学模型. 如符合线性动力学模型, 则分别计算出九种情况的结果 5 J6 q7 B s0 `8 E0 d$ Z5 w c
: 一, 二, 三房室各用 1, 1/C, 1/C/C 三种权重; 如符合非线性动力学模型, 则计算出 6 v& T- n# |9 x6 R
三种情况的结果: 一房室三种权重. 3 W! n0 ~4 C' e! j4 L- H. l0 q$ ~
2. 批处理的计算 - L" I% G; a- h8 Q1 y
在屏幕显示主菜单后, 键入数字 3 屏幕显示出: "BATCH COMPUTATION"(批处 # Y. }( L3 D1 d2 N9 i* l8 |
理计算). 对批处理计算, 要依次回答出现在对话区中的提问: - [. Q4 C8 N" e* S; G+ A1 A q
(1) 文件名 : L J4 P: K# ?/ j
(2) 选择模型 用户可根据屏幕右栏中显示的十五种模型, 键入所选模型前面的
% r c. v% t9 R4 q$ C( _' e" F数字即可. 有关选择模型的方法可参考下面六. 1. 1.1 的说明 1.
# g/ Q1 c; E7 M9 H5 K* j; u# A(3) 选择权重 用户可根据屏幕右栏中显示的三种权重, 键入所选权重前面的数 . ?$ Y1 I0 S% y- v9 {5 U3 E+ a- X
字即可. 有关选择权重的方法可参考下面六. 1. 1.1 的说明 2. ' v) A. [7 i2 Y: z0 U
3. 指定算法和条件的计算
8 }' H3 o! a- r; K2 ?: v* l, S在屏幕显示主菜单后, 键入数字 4 屏幕显示出: "SPECIFIED COMPUTATION"( : D) P2 a4 G4 ^1 ?! ?( T7 m
指定计算). 对指定计算, 要依次回答出现在对话区中的提问: , V( I! K. ~- l: G/ T$ u+ D2 {
(1) 文件名
* S! d5 B) n! w& D+ ~* o) s: k(2) 要计算的数据号 用户要了解数据号, 可以用输入菜单的第七项打印出清单 % m, o& Y9 A: G- F8 K, s1 b1 m
(3) 存入计算结果的记录号 屏幕提示该号应大于已存有结果的记录号, 因此用
/ p1 U, ~8 u V. F" X户键入的数字一般应大于已存有结果的记录号的数字, 除非用户想用新算出的结果替换原 ) H: V. z" A) `# Q9 N' W
有的结果.
- B; n3 R8 S H0 b" K8 s0 e(4) 选择算法 根据屏幕右栏中显示的四种方法, 键入所选方法前面的数字.
]8 D& [% W: F2 x5 p ~- i7 H" O(5) 选择模型 根据屏幕右栏中显示的十五种模型, 键入所选模型前面的数字.
+ d- R9 {0 X& ~9 H给定收敛精度 例如取 0.001 或 0.01. + A0 b1 w% j3 F2 H9 A( O: n! c
(7) 确定初值选择方法 按屏幕右栏显示的三种方式由用户指定:
, \) i7 R# L8 M% P3 X) G(7-1) 自定初值 根据提示由键盘键入 ' i5 s. Y: o8 h% S( f& q! B
(7-2) 半自动确定 用户根据屏幕显示的曲线转折点的位置, 由后向前计数, * I- l- C7 T# G7 x" n$ u
键入转折点的序号, 由程序用残数法计算初值.
6 J/ t" z6 E$ x(7-3) 自动确定 由程序自动计算初值.
2 R$ @. }# }* s6 j1 l$ ^1 b当对话区显示出 "Initial Values Gained, Press any key to continue" 表示初值 + V: _; ^( S; _6 l n5 r0 C' e5 ]
已算好, 按任一键开始自动计算. ( C) u4 E }" w
六. 计算结果的输出
" c7 y& o5 R# z* d* _. p) a# ?' g在屏幕出现程序主菜单后, 键入数字 5 调出输出程序, 屏幕显示出 File Name # x, {9 \' z. Q: _: O5 ]) O1 ~
键入文件名并予以确认后, 显示出输出菜单(OUTPUT MENU):
3 _7 T' H4 }8 L: o3 d: D" A _8 x1. 常规打印输出
u( t5 b( @ x& i2. 显示个体数据计算结果 & W3 |; w7 E+ K- Z8 |/ H0 k
3. 绘制相关图及散点图 O1 C( s, l- a
4. 打印输出文件清单 ' F9 y( T! P5 g) L. n$ O
5. 返回主菜单
6 ~% M) l- k% O1. 常规打印输出 在屏幕显示输出菜单后, 键入数字 1 显示出常规打印输出菜 " k G( I$ T$ g! I2 k9 y
单(PROUTINE PRINT OUT): - Q! K1 E; o) z1 D
1. 打印标题文件
/ m D6 m0 z; Q/ [2. 打印供选择模型用的计算结果
; R! D+ @& s! {# F- g. m3. 打印批处理的结果
L( L( g" Z' t9 k, f# }4. 打印用户指定计算的结果
3 y3 L* T) `- a& A- J5. 打印个体数据的计算结果
1 D8 t7 d+ M9 W0 ?% b( v$ H6. 打印统计矩的结果 6 U' F4 V% ^- v4 x! l* w
7. 返回输出菜单 l. K2 h4 \6 P& q
在屏幕显示出常规打印输出菜单后, 键入相应数字即可完成对应的工作.
! S9 F4 u& i" x# @1.1 供选择模型用的计算打印出的主要内容及几点说明 : T6 b; y& w' h
在屏幕显示出常规打印输出菜单后, 键入数字 2 即可打印出如下主要内容.
$ g& G. {6 u1 o9 y; V1 B+ a$ \(1) 拟合优度比较表 表中列出记录号, 组号, 权重, 房室数及以下内容: 4 d s5 M' H- f1 `" |
加权残差平方和(WSS)
. ^1 [# \, E h相关系数(R) ( N! D f2 y( T! Y/ h' ]
确定系数(R*R)[=1-WSS/LYY] 1 U, v( s, V' M' w9 b
拟合优度值[=SQR(WSS/(N-P)) SQR(A) 表示开 A 的平方, N 是浓
+ H* w4 o# D+ Z- }% \度--时间数据点数, P 是参数个数]
% O, G* r9 i. ^: N; r2 i9 @最大绝对误差(MAE) ) ^( ~( `6 c1 i9 L1 ]* b
最大相对误差(MRE) 1 I" e% e5 J7 o. `* H$ R
AIC[=N*LN(WSS)+2P LN(A) 表示取 A 的自然对数, P 是参数个数] - o# O2 T0 U3 i) Q- ~
游移检验(Run Test) [是各点实测浓度与计算浓度差值正负号变化
* I0 B! u9 g9 Q \的次数]
$ H/ i' s6 f$ W5 X/ c, w( f(2) 拟合曲线图 将九种情况(一, 二, 三房室各加 1, 1/C, 1/C/C 权)的计算结 ! ~" x" r% c2 n' h$ x
果用 C--T 曲线及 LN(C)--T 曲线表示
1 r; |6 z3 X3 J- P(3) F 检验 各种权重下两种房室模型之间的 F 值和 P 值 ) f7 {$ X$ V- \/ \8 {
(4) 统计矩计算结果 [AUC, AUMC, MRT, VRT]
9 G {/ o" E! `% {; m4 f6 Q说明1. 关于房室数的选择 可根据 F 检验和 AIC 值选择房室数. 对于相同的权, 当
% o) O/ |. o9 [7 e6 ~6 I2 B, VF 检验有显著意义(P<0.05 或 P<0.01)时, 应取 AIC 值较小的房室数, 当 F 检验无显著
1 v* G* L! ?+ l6 {% p$ W" s意义(P>0.05)时, 则取房室数少者为宜.
9 T6 B; F c. u; P+ E" O说明2. 关于权重的选择 如何选择权重, 至今意见不 一, 以下几点意见可供参考: 0 l8 F8 F' R# ^2 j" z& v
首先比较拟合优度值(Goodness of fit), 数值越小越好, 如数值相等或相近, ' t( [$ v) q8 z) ?9 }
再同时结合最低检测浓度, 参考最大绝对误差和相对误差. 一般说来, 权重为 1 时, 最 ; s+ \' u) q. d: d- f7 ~
大绝对误差较小, 对高浓度数据部份拟合较好, 有利于计算表观分布容积及生物利用度, ; s9 D2 p+ v9 B* d1 \$ U
权重为 1/C/C 时, 最大相对误差较小, 对低浓度数据部份拟合较好, 有利于计算消除相
3 R, ~3 J8 c' L; G& b+ l# s" T半衰期, 权重为 1/C 时, 通常能兼顾高低浓度两部份数据, 但最大绝对误差及相对误差 5 q+ I# D2 z: l0 \
往往并非最小. 1 S5 w {/ r1 N% ~2 b6 M* r! v
1.2 批处理计算打印出的主要内容
4 s+ |; e- M- _7 p4 X在屏幕显示出常规打印输出菜单后, 键入数字 3 即可打印出如下主要内容. - A' S0 o4 R/ @9 S# G9 Y; [3 K% `
(1) 批处理拟合优度表 内容同 六. 1. 1.1 (1) ) R0 G2 A6 T8 i0 ~. E* t" ~4 ~
(2) 一级参数表 . q. t3 z* J7 i ~/ P: p
(3) 二级参数表
9 ] ^6 x& t8 d3 n+ G; {# M一级和二级参数表中均给出各剂量内各个体的参数值, 平均值, 标准差和标准误.
0 F) p2 o& i/ {(4) 统计矩计算结果 [AUC, AUMC, MRT, VRT]
! X6 F# h2 ~$ O; I1.3 用户指定计算打印出的主要内容 % F" H( _5 I& `$ P" O
在屏幕显示出常规打印输出菜单后, 键入数字 4 可打印出如下主要内容:
! L5 U3 D" L ^2 v. n拟合优度简表, 各记录号的详细内容. 这些内容可用本菜单第 5 项功能打印出来,
! H. y1 e5 h/ y) `$ c- p# n或用输出菜单第 2 项功能显示在屏幕上.
* N) Q3 R5 v- ^/ O# Q$ n B; q( H1.4 个体数据计算的详细输出
1 H/ }+ P# ~! B在屏幕显示出常规打印输出菜单后, 键入数字 5 进入个体数据计算结果的输出. 再
) j+ n* p( M. {4 O1 R: \5 z. u6 e键入起始和终止记录号, 即可依次按下列顺序打印出各记录的详细结果:
) f' w7 U) [' ]标题及计算条件; 拟合优度数据及药代动力学参数; 浓度实测值与计算值比较表 ; O8 j6 o+ U' P, Y' S
; C--T曲线图; LN(C)--T曲线图. 如果记录号的内容是用统计矩法计算的, 则只打印出统 3 E( D0 `6 ]( G' I& W) c5 e
计矩参数. t. [9 |* i- C9 c
1.5 统计矩计算结果的输出 $ _, s2 ?, K' n R, H
在屏幕显示出常规打印输出菜单后, 键入数字 6 进入统计矩计算结果的输出 ) s7 e e* S; J1 `% L L& Q
, 将主数据及批处理统计矩参数依次打印出来. 3 v8 ~8 X- z) I8 @: x2 s5 f0 M$ H
2. 个体数据计算结果显示 ; G) x2 m, r. q& A; A5 _
在屏幕显示输出菜单后, 键入数字 2 进入个体数据计算结果显示. 再键入起 2 }9 G. {+ a: c! M+ V
始和终止记录号, 则依次打印出以下内容:
5 ?: V) `% \# O# q- ^# L ^6 @# q/ [标题及实验设计; 记录号; 计算条件及拟合优度数据; 一级药代动力学参数
+ H5 s. s. G- T# W; 浓度实测值与计算值比较表; 药代动力学参数表; 统计矩参数表( 只含有统计矩计算的
7 w1 {$ Y3 q# r8 L# w记录号, 才显示此结果); C--T 曲线图; LN(C)--T 曲线图.
8 ~- T* G/ E( N _3. 绘制相关图及误差散点图
0 s8 e6 V$ Z4 L3 H在屏幕显示输出菜单后, 键入数字 3 则显示相关图及误差散点图. 图形可直 5 w- F' v. X0 r; D
观的反应: 实测值与计算值的相关关系; 不同时间的误差分布; 不同浓度的误差分布. 这 ' `( l) J' h, z U9 S9 \
些图形可供药代动力学分析和研究时参考.
7 _8 f. ]* L+ d4 r3 K4. 打印输出文件内容清单 2 t3 A" k( t3 H- H, i/ z+ w
在屏幕显示输出菜单后, 键入数字 4 即可打印输出文件清单, 内容有: 各记
: R2 f/ ^2 M# C2 b0 _1 e- z录号的计算方法; 权重; 房室数; 各剂量组主数据序号和各个体数据序号. % z' `% j8 n) I/ V& s& ~+ K
七. 用简化系统计算药代动力学参数
" I* y5 Q4 _" u/ z, \, y简化系统是对个体数据进行简便计算的专用程序. 在屏幕显示出主菜单后, 键入 2 [: s' S% B8 s
数字 6 即进入药代动力学参数计算的简化系统. 用户只须按屏幕显示出的表格依次键入
+ W: \+ z4 {" h9 n- D! H- r有关内容即可建立标题文件(见四. 1. 1.1); 指定给药途径(见四. 1. 1.2); 输入浓度--
1 c6 b; {2 V$ |时间数据(见四. 1. 1.5). 之后, 自动按 五. 1. 所述方法进行计算, 无需指定算法, 收
x9 A3 j. ]$ {" `8 n/ {敛精度, 房室数, 权重. 计算完毕后, 自动打印出以下主要内容: 3 H$ [2 M* q* p3 _
1. 药代动力学模型及条件. 包括指明是线性还是非线性房室模型; 房室数; 用药
" Z c. A+ _) G' P) x3 w途径; 计算方法; 权重; 收敛精度等.
+ \: |: f) t* ]2. 拟合优度数据. 内容有: 加权残差平方和; 残差均方; 相关系数(R); 确定系 : M2 N& O: ~7 A' C& I
数(R*R); 最大绝对误差; 最大相对误差; 游移检验等. 8 z7 q" o: ^% r
3. F 检验. 列出房室间的 F 检验表, 供选择模型时参考. " K$ Q6 U* U' s. v. g- v& g7 u
4. 药代动力学参数. 包括一级和二级参数.
+ q4 w5 B9 v# `" N9 C: J5. 浓度实测值与计算值比较表: 列出时间, 浓度实测值, 浓度计算值, 绝对误差
/ z! G5 f c9 ~( ]5 N" E0 r和相对误差.
) X6 b3 L; w( c' a: R6. C--T 图和 LN(C)--T 图.
2 Q/ R0 w8 h6 J' J$ s3 ?7. 选择权重: 简化系统第一次输出的是权重为 1 的计算结果, 如用户希望了解 3 X. ?0 @2 [+ b2 k: B& N! ]* S
权重为 1/C 或 1/C/C 的结果, 可回答屏幕上显示的提问, 键入相应数字即可打印出对应 7 X3 G8 G: m! M8 C$ r
的结果.
3 C' Z$ B$ r, ~. N5 k" \* D6 S' m1 ?9 _+ s1 {2 ^
MathType 5.2
$ [3 f0 @" `7 z% H8 { r1 q! B4 r9 P
MathType 5.2是一个强大的数学公式编辑器，与常见的文字处理软件和演示程序配合使用，能够在各种文档中加入复杂的数学公式和符号。MathType 5.2 与常见文字处理工具紧密结合，支持 OLE (对象的链接与嵌入)，可以在任何支持 OLE 的文字处理系统中调用 (从主菜单中选择 "插入->对象" 在新对象中选择 "MathType 5.0 Equation" )，帮助用户快速建立专业化的数学技术文档。MathType 5.2 汉化版修正了部分对中文的支持，这个版本对 Word 或 WPS 文字处理系统支持相当好。实现所见即所得的工作模式，它可以将编辑好的公式保存成多种图片格式或透明图片模式，可以很方便的添加或移除符号、表达式等模板(只需要简单地用鼠标拖进拖出即可)，也可以很方便地修改模板。总之，功能多多，熟练使用了就知道它的强大了。MathType 5.2 可用在编辑数学试卷、书籍、报刊、论文、幻灯演示等方面，是您编辑数学资料的得力工具。
$ j7 l9 n% k* z" b/ y Mathtype 5.2 提供以下功能：①、直观易用、所见所得的用户界面，与 Windows, Macintosh 环境中各种文字处理软件和出版软件兼容。②、自动智能改变公式的字体和格式，适合各种复杂的公式，支持多种字体。③、支持 TeX 和 LaTeX，以及国际标准 MathML，并能够把公式转化为支持 Web 的各种图形 (Gif 等)，也支持 WMF 和 EPS 输出。④、附加几十种专用符号字体，数百种公式符号和模版，涵盖数学、物理、化学、地理等科学领域。 |
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赣公网安备36040302000210号 )|网站地图
狗仔卡
发表于 2006-8-19 11:42:03
提升卡
置顶卡
沉默卡
喧嚣卡
变色卡
显身卡
发表于 2016-3-17 14:59:45
