【推荐】pubmed 检索具体操作方法

高塔

近年来，随着INTERNET的普及，一些机构通过INTERNET提供MEDLINE数据库免费检索服务，如美国国立卫生院提供的PubMed检索系统(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/)、由广告商提供的HEALTHGATE检索系统(http://www.healthgate/medline/search.html)和MEDSCAPE检索系统(http://www.medscape.com/misc/formmedlineinflive.html/)、HELIX检索系统(http://www.helix.com)、MEDEC检索系统(http://medecinteractive.com/)等、AVICENNA检索系统(http://www.avicenna.com/)等。其中PubMed数据更新快，检索系统比较完善，深受广大医务工作者和图书情报人员的欢迎。但由于不少使用者不熟悉PubMed的使用方法，因而不用或少用，即便使用，检索结果也不太满意。本文拟简要介绍PubMed及其具体操作方法。
. h4 M0 Z9 _8 ]. I: v7 o7 `' z　　PubMed检索系统所提供的书目信息数据库主要来源于MEDLINE和PREMEDLINE。其中PREMEDLINE是指将要进入MEDLINE数据库的文献先做成一个数据库，数据为每天更新。PubMed提供了强大的技术支持。使用户可以非常容易地在普通检索界面进行检索(普通检索界面可通过布尔逻辑组配执行高级检索界面的功能)。
; Z$ r! C, N$ E
( H( }- V$ S6 B- W# b$ c1　主题检索

! R. D8 {$ ?2 U0 w5 D　　在检索式提问框中输入一个或更多的词，然后按回车键或用鼠标点击`search'按钮，PubMed就会利用`自动词语匹配'功能将重要的词或词组用`AND'组合在一起进行检索。当然，也可使用MeSH/副主题词组配格式(MeSH为Medical Subject Headings的缩写，是美国国立医学图书馆编写的医学主题词表)，如neoplasms/diet therapy［mh］**。“自动词语匹配”是检索系统将输入的检索词根据MeSH注释表、期刊名注释表、常用词组表和作者索引进行匹配。
+ V! C! q+ u/ j3 I# _. b7 Y
1.1　MeSH注释表
* ~+ U* k* N3 }5 b: h
, U3 N, G- J) I: [　　MeSH注释表包括MeSH词、副主题词、MeSH词相关参照(也称款目词)、物质名称、物质名称同义词等。如果输入的检索词在注释表中发现有匹配的词，则该词将被作为MeSH词和自由词(即textword)同时进行检索。例如，如果我们输入Vitamin h,PubMed会这样检索：(“Biotin［MeSH］OR itaminh［tw］)——vitamin h是MeSH词Biotin的款目词。
' ^& {, |( r2 z! x& u
* r6 A. D' s0 T; ~0 Y% U! H, v1.2　期刊名注释表

　　包括期刊名全称、期刊名MEDLINE缩写、ISSN号。例如，如果你输入“New England Journal of Medicine”，PubMed将按“N Engl J Med［ta］”查询。

7 T! |2 t0 p# o, U2 x' A1.3　常用词组表

0 J  ?% a' B* a3 b5 n# N　　如果在MeSH注释表或期刊名注释表中未发现匹配的词，PubMED就会检索来自MeSH、物质名称、题名和文摘中多次出现的常用词组表，例如cold compresses。
9 ?2 L1 _$ K4 V/ `
* {! b4 Z4 `3 s, s* k. @- X1.4　作者索引

　　如果输入的检索词在以上词表中未找到，且该词后有一或二个字母，PubMed就会查检作者索引。如果在作者索引中仍未找到匹配词，PubMed就将该词组分开并重复上面的查找过程。如果还没有匹配词，PubMed将该词组的每个单词用`AND'组配并在所有字段中查找。

0 @+ y& m; n- c$ _) x2　作者姓名检索

) j% Q6 @6 |3 |! a5 _　　输入作者姓名时应采用姓+名(名的首字母缩写，不用标点符号)的格式，例如SmithJA。PubMed将自动地截取作者姓名中名的首字母以适应不同的名缩写。如果只输入作者的姓，PubMed会在包括作者字段在内的所有字段进行检索，例如只输入Yang,则PubMed将象下面一样检索：Yin-Yang［mh］或Yang［tw］。此外，如果使用双引号“”将作者的姓全称和名的第一个首字母引起来，并用作者检索字段标识符［au］限制，如“smithj”［au］，PubMed将关闭自动截词，且检索姓名中名只有一个字母缩写的作者。
3 T  d3 l7 z4 v/ w! z6 a" L
3　期刊名称检索
) \  w# [* |/ T
" z9 i1 b. \$ w　　可以输入期刊名全称检索，如molecular biology of the cell;期刊名MEDLINE缩写名称检索，如molbiolcell;或ISSN号检索，如1059-1524。
　　如果期刊名称正好是医学主题词表(MeSH)中的词，例如genetherapy、science、cell,PubMed会将其当作MeSH词进行检索。因此，在此种情况下应使用期刊名称检索字段标识［ta］，如genetherapy［ta］。
3 ^. B$ C8 N# T) S　　如果期刊名称是一个单词，也需要使用期刊名称检索字段标识，如scanning［ta］，否则会在所有字段检索该词。
- b9 _9 x% Y* b7 O# l　　推荐使用期刊名称全称或MEDLINE缩写形式检索期刊。同时需要注意的是，在以前的引文中，ISSN号是不能保证的。

. f9 A. `1 u; C' q- f5 n" E4　截词检索
8 V/ x# i; z5 O* t+ Z% i
5 P4 U8 t# L. Q- j+ c' w7 q　　在词的末尾加*号，PubMed就会检索出以该词为词根的所有词，例如，staph*，但不包括*号后有一个空格的词组，譬如，infection*包括infections，但不包括infection control。此外，截词检索将关闭自动词语匹配功能，也不能进行扩展检索。如：heart attack*不会匹配MeSH词，也不会扩展检索my-ocardial infarction、myocardial stunning、shock,cardiogenic这些方面的文献。
' a3 A: V5 p) z/ v/ c5 z. `
5　词组检索(规定PubMed检索一个词组)

+ b6 K; ?$ u7 x2 ~# r  `　　如果PubMed检索在常用词组列表中已有的词组，如poi-son ivy,PubMed就会把它作为一个词组来检索。但有时Pubmed可能找不到相应的词组，如brca1，此时可通过给一个词组加上双引号，使得PubMed将其当作一个词来进行检索，如“brca1”。需注意的是，使用双引号规定PubMed进行词组检索，PubMed就不会执行自动词语匹配功能和扩展检索功能。
* Q- P3 K& f4 B
6　每页显示的文献数量
3 F% f2 \2 j! J- g1 q7 y
　　PubMed将检索出的文献记录按每页20条显示(缺省值)。要改变缺省值，单击`number of documents to display perpage'下拉菜单，并选择一个更大的值。
* U4 Q& u$ x- e. S: I# y
7　检索时间范围限制
2 j; P+ d6 U+ P5 h1 z
　　使用`entrez date limit'下拉菜单可限制检索时间范围。`entrez date'是引文追加到PubMed数据库的日期。引文以文献记录入库时间顺序显示(倒序)。

8　检出文献记录显示格式

) B: e) r& |# u! \" h$ @2 f# o　　使用“abstract report”(PubMed缺省显示方式)下拉菜单可选择文献记录显示形式。
　　①文摘报告：包括期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有)、出版类型、PubMed和MEDLINE登记号等。
　　②引文报告：期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有)、出版类型、MeSH词、资助号、PubMed和MEDLINE登记号等。
1 E" G0 t9 X' k# T: j$ I+ D　　③MEDLINE报告：MEDLINE记录格式，采用二个字母的文献记录字段标识符。

9　PubMed检索规则与语法

7 H0 ~5 D; L. A! M8 n6 r6 l　　①布尔运算符AND，OR，NOT必须大写，例如，vitaminc OR zinc；
　　②PubMed从左至右进行布尔运算。不过，你可以通过加圆括符改变运算顺序，如commoncoldAND(vitamincORzinc)。
　　③指定文献记录字段名称检索，如dna［mh］ANDcrick［au］and1993［dp］。下面列出常用字段名称缩写：
　　DP——出版日期　采用YYYY/MM/DD［DP］格式，如1998/03/06［DP］。输入日期范围则用冒号连接，如1996：1998［DP］，1998/01：1998/04［dp］
　　AD——第一作者机构名称、地址、资助号　如LM05545/LM/NLM［ad］
  d) q6 h7 R; v. ^　　AU——作者姓名　如o'brienj［au］
+ {) l  j# C1 l　　TA——期刊名称　包括期刊名全称、简称、ISSN。jbiolchem［ta］或0021-9258［ta］
　　LA——文献出版语言　Chinese［la］
　　MH-Mesh主题词　neoplasms［mh］或neoplasms/dt［mh］
　　PT——出版类型　review［pt］
　　TW——自由词　AA001794［tw］
& w# z3 M% l% Q: r3 o　　T1——文献标题内自由词leiomyosarcoma［ti］
, X' h1 ?8 N0 ~$ o1 x0 `　　④经常通过单击Details按钮观察PubMed怎样运算你的检索策略，并不断修正检索策略，以达到最佳检索结果。
10　PubMed在提供的文献记录中，有些记录中出现有彩色标记的期刊名称缩写按钮，用鼠标点击该按钮，部分期刊将免费提供该记录的全文。