matlab中运用正则表达式处理txt文档的问题

nxhylyh

' Y  `9 B. A# ]9 L: N
- h% n6 v0 @/ }6 z* F$ L先说点废话~老师在寒假给小弟一个课题，就是在MATLAB中运用正则表达式来处理txt文档,小弟matlab新手~正则表达式中文资料太少了~英文又太差劲，所以对英文资料只好自动过滤了~摸索了半个多月，删删改改，论坛也去了好多个·~~自~希望大家看看~先介绍下附件1的格式:

>AB016625
GCGGCCCAGGCCCGGAACCTTCCCTGGTCGTGCG
>AF008216
. B# {6 {( h3 O% RAAGCTTTCCT

题目1:将'>'符号后跟的的字符串(母字符串)提取出来并建立以字符串命名的文件夹(如文件夹ABO16625,文件夹AF008216)
题目2:在相应的文件下建立base.txt
题目3:将母字符串下面的字符串(子字符串)提取出来储存在相应的base.txt里面
$ a6 C" a' ~# S. W6 C0 O+ D8 C这3个题目，小弟摸爬滚打算是做出来了，共享如下:

1. 
   0 n- X7 D  T6 Z: o6 [
2. clc;clear;
   / b: @& I' \, w% L! C3 B) v
3. file=fopen('fasta.txt','r');
   5 O1 p$ j: u; N2 T' `
4. fname={};fname1={};
   3 T( D. ^: Y# D) u- s# R
5. fbase={};
   
6. while feof(file)==0
   " Q% v5 g- \! b  G" G9 g
7.       str=fgetl(file);
   1 V- s8 L1 A# z5 I
8.       fname1=regexpi(str,'(?<=>)[A-Z0-9]+$','match');
   4 m+ h: J& J  d! R. S* @! S8 p
9.       fbase=regexpi(str,'^[a-z]+$','match');
   0 l% e5 d* j1 e2 V) n  p
10.       if ~isempty(fname1)
    / F( P/ T+ O! Z5 E) V/ }9 X
11.         mkdir(fname1{1});
      {/ X! A1 C4 ?
12.         k1=strcat('D:\mat\work\',fname1{1},'\base.txt');
    
13.         fname=[fname; fname1];
    5 ]8 L/ n3 X9 \7 Z: B% [7 f
14.         fname1={};
    3 O) d/ o& l4 l: N5 K) s
15.       end
    
16.        if ~isempty(fbase)
    2 U: J2 a3 `' E$ V
17.         fid1=fopen(k1,'a');
    * v8 s! h* y# Q- y9 R% i
18.         fwrite(fid1,fbase{1});
    : d5 q+ |) |& v4 ~8 k, D
19.         fclose(fid1);
    
20.         fbase1={};
    * B0 }& M6 Y2 ~8 r8 w4 w& y
21.        end
    3 i' Q0 N+ R  U5 e9 c8 w2 a7 O
22. end
    * w( W8 p* {" _  T5 ?
23. fclose('all');
    1 u  P+ D6 B4 C: W

复制代码

但是接下来的题目小弟实在困惑不已，望各位指教
! [8 I& b* p+ k  r6 L先介绍hmrcds格式:
4 ?" J% P5 V* ?( `! ^

9 S; N0 g- x+ \$ J$ d3 K: ~AB016625 12 24 35 67
AF008216 12 15
U25134 11 15

) K! M, N$ |; j% l* E题目4:在相应母字符串命名的文件夹下建立cds.txt文档
题目5:将hmrcds中母字符串后的纯数字字符串提取出来存在各自的cds.txt中
题目6:在相应的文件夹中，由cds.txt中储存的偶数个数字为根据，提取出base.txt中的字符串,并储存在由此在相应文件夹下建立的ex1.txt,ex2.txt……中~,例如在AB016625命名的文件夹下,在base.txt中取出12-24的字符串存在ex1.txt,取出35-67的字符串存在ex2.txt中~
是不是看的头大~~~

题目4小弟可以做出来，题目5，小弟用正则表达式实在做不出来，题目6还没做到
* l* z9 P# m2 W另外，小弟今天知道用
" x& q+ {  q& }$ s, ]f = fopen('fasta.txt','rt'); % t 属性根据需要可省略
x = fread(f,'*char');
fclose(f);
( c7 \" B8 R, k- ~" Lx=x'
5 K# |* S) a; o# H2 u8 |' Y! v可以将文档以字符串形式读入(textread读取后是一个cell格式),于是就用
: v1 C* S! X3 H  x3 [fname1=regexpi(x,'(?<=>)\w+','match')
来完成题目题目1中的提取母字符串，结果在matlab运行后，不出现结果，同时cpu使用达到50%，不知道怎么回事~大家指点小弟下吧~~~
* h7 z* O2 A8 d7 C, D崩溃。。附件上传了但是黏贴不了。不知道怎么回事有需要的加我Q Q : 1036300382